Daily Archives: 2010-06-22


OpenPCR ή αντιγράφωντας DNA με τον open source τρόπο 3

Lego DNAΚατ’αρχάς να προσδιορίσουμε λίγο τι σημαίνει PCR, τα αρχικά PCR προέρχωνται άπο την polymerase chain reaction ή επί το Ελληνικότερο αλυσιδωτή αντίδρασης πολυμεράσης. Η μέθοδος αυτή χρησιμοποιείται στην βιοχημεία και την μοριακή βιολογία για την απομόνωση και πολλαπλασιασμό μιας αλληλουχίας DNA χωρίς την χρήση ζωντανών μικροοργανισμός αλλά μέσω ενζυμικής αναπαραγωγής του DNA.

Η PCR αποτελεί βασικό εργαλείο στις σύγχρονες επιστήμες υγείας. Η PCR χρησιμοποιείται στην καθημερινή ιατρική και ιατροδικαστική πράξη. Χρησιμοποιείται για τον εντοπισμό νοσημάτων όπως η λευχαιμία και τα λεμφώματα, όπως και επιτρέπει τον εντοπισμό και την ταυτοποίηση νοσημάτων των οποίων η καλλιέργεια είναι πολύ δύσκολο, (βλ. πχ ιό της γρίππης) και άλλα.

Ο ιδιαίτερα φιλόδοξος στόχος του OpenPCR δεν είναι να αντικαταστήσει πλήρω τα μηχανήματα PCR που χρησιμοποιούνται στα νοσοκομεία και σε διάφορα εργαστήρια. Αντίθετα είναι η δημιουργία μιας συσκεύης PCR που θα βασίζεται στο ανοιχτό hardware controller Arduino και όλος της ο σχεδιασμός, το λογισμικό και η τεκμηρίωση θα είναι ανοιχτού κώδικα και μάλιστα το κόστος του kit θα είναι στο ύψος των 400$.

Παρακάτω ακολουθεί ένα βιντεάκι που ο δημιουργός εξηγεί γιατί δεν αρέσουν σε κάποιους τα λαχανάκια Βρυξελλών.

(more…)